The Human Centipede, bir Alman tıbbi akademisyen olan Dr. Heiter tarafından kurgulanan acımasız bir komplo üzerine kurulmuştur. Heiter, bir korku filmi olarak bilinen, bir insan merkezli böcek gibi dizilmiş üç insanın birbirleri ile bağlantılı olduğu, tehlikeli bir deney yapmaya karar verir. Dr. Heiter, kurbanlarının vücutlarını birbirine bağlayarak, bir insan centipede yaratmaya çalışır. Çıldırma noktasına gelen Dr. Heiter, kendi kötülüklerinden kurtulmak için, kurbanlarının vücutlarını birbirine bağlayıp, korneadan başlayarak kulaklarına kadar bağlar. Bu tehlikeli deneyin sonucunda, kurbanlarının vücutları birbirine bağlanır ve üç kafadan oluşan bir insan centipede haline gelir.